以细菌和病毒引起者最为常见。少数急性肠炎病因不明。细菌性急性肠炎的致病菌以痢疾杆菌最常见,其次为空肠弯曲菌和沙门氏菌。在病毒性胃急性肠炎中,轮状病毒是婴幼儿腹泻的主要病因,而诺瓦克病毒是成人和大龄儿童流行性病毒性胃急性肠炎的主要病因。寄生虫引起的急性肠炎以溶组织内阿米巴较为常见。真菌性急性肠炎以白色念珠菌引起的最多。 此外,休息无规律和精神过度紧张也是引起此病的一个原因。

急性肠炎的原因较多,主要原因如下:

病毒性急性肠炎

病毒性急性肠炎见于犬瘟热病毒、犬细小病毒、犬猫冠状病毒、猫泛白细胞减少病病毒等引起的急性肠炎。

细菌性急性肠炎

细菌性急性肠炎见大肠杆菌、沙门氏菌、耶尔森氏菌(引起小肠结急性肠炎)、毛样产芽胞杆菌、空肠弯曲杆菌、梭菌(犬出血性胃急性肠炎)等引起的急性肠炎。

真菌性急性肠炎

真菌性急性肠炎见组织胞浆菌、藻状菌、曲霉菌、白念珠菌等引起的急性肠炎。

寄生虫性急性肠炎

寄生虫性急性肠炎见鞭毛虫、球虫、弓形虫、蛔虫、钩虫等引起的急性肠炎。

饮食导致的急性肠炎

采食异物、污染或腐败变质食物、刺激性化学物质(毒物或药物等)、某些重金属中毒,以及某些变态反应(嗜酸性细胞性急性肠炎、浆细胞淋巴细胞性急性肠炎)等都能引起急性肠炎。

药物导致的急性肠炎

滥用抗生素,改变了肠道存在的微生物区系,或出现耐抗生素菌株而引起的急性肠炎。